Автоматизированное рабочее место микробиолога
Микроб-2 и Микроб-автомат. Программное обеспечение для микробиологии
Программа «Система микробиологического мониторинга «Микроб-2»» предназначена для создания базы данных с целью мониторирования микробного пейзажа и уровня антибиотикорезистентности выделенных микроорганизмов в клинических микробиологических лабораториях лечебных учреждений, диагностических и научно-исследовательских медицинских центров. Программа «Микроб-2» — сетевая версия, позволяющая в рамках лаборатории создавать необходимое количество рабочих мест, может быть интегрирована в медицинскую информационную сеть. «Микроб-2» импортирует из программы «Микроб-Автомат» результаты идентификации и чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам. Система является открытой, в рамках вложенной в нее классификации Пользователь может самостоятельно дополнить следующие разделы: антибиотики, диагнозы, биоматериалы, микроорганизмы.
Система микробиологического мониторинга «Микроб-2» включает экспертную систему, производящую оценку данных, полученных в результате проведения исследований по идентификации микроорганизмов и определении их антибиотикочувствительности in vitro, и коррекцию их на основании сведений о природной устойчивости и чувствительности отдельных микроорганизмов или их групп, о распространении среди них приобретенной резистентности, а также сведений о корреляции данных по чувствительности, полученных In Vitro и клинической эффективности антибактериальных препаратов.
Способ введения антибиотикограммы определяется Пользователем путем выбора одного из трех вариантов: «по степени чувствительности», «по диаметру зон», «по значениям МПК». Идентификация более 500 видов микроорганизмов и патогенных грибов при использовании данной программы проводится автоматически при визуальном считывании результатов биохимических тестов коммерческих тест-систем.
Сформированный бланк анализа проходит автоматическую экспертную оценку. Экспертная система ограничивает влияние недостоверных данных, полученных при идентификации микроорганизмов и определении их антибиотикочувствительности на общую картину микробиологического мониторинга микробного пейзажа и уровня антибиотикорезистентности и предупреждает назначение заведомо неэффективной антибактериальной терапии.
Основные характеристики:
- Идентификация микроорганизмов: проведение идентификация микроорганизмов в данной программе основано на изучении морфологических, культуральных свойств и биохимической активности с использованием коммерческих микротест-систем при визуальном считывании, позволяющих одновременно определять от 7 до 24 и более различных ферментативных реакций в течение 4-48 часов. Для этого на каждую группу микроорганизмов, идентифицируемую с помощью конкретной тест-системы, составлен «банк данных», представляющий собой обобщенные сведения о частоте встречаемости того или иного теста у микроорганизмов различных видов. При идентификации каждого микроорганизма программа в результате обработки введенной информации выдаёт следующие расчетные данные: «Результат идентификации», «Несовпавшие тесты» и «Дополнительные тесты».
- Регистрация результатов определения антибиотикочувствительности: предусмотрена возможность 3-х способов введения данных: в степенях чувствительности (чувствительный, умеренно устойчивый и резистентный), диаметрах зон задержки роста и в МПК (минимально подавляющие концентрации) с автоматической интерпретацией в степень чувствительности.
- Получение готового бланка анализа формы 240/У и 239/У согласно Приказу МЗ СССР №1030 от 04.10.1980, включающего паспортную часть (№ анализа, дату поступления и выдачи, ФИО больного, № истории болезни, название отделения, диагноз, наименование биоматериала), результаты идентификации выделенных микроорганизмов и результаты определения их чувствительности к антибактериальным препаратам.
- Экспертная система: основой для разработки экспертной системы являются данные о природной устойчивости отдельных микроорганизмов или их групп, о распространении среди них приобретенной резистентности, а также сведения о клинической эффективности антибактериальных препаратов. Известно, что данные по антибиотикорезистентности к каждому из препаратов подгруппы могут быть с высокой долей вероятности экстраполированы на всю подгруппу. Полученные результаты при определении антибиотикочувствительности In Vitro необходимо сопоставлять с данными о природной чувствительности и возможном распространении среди них приобретенной резистентности. Таким образом, экспертная система призвана ограничить влияние недостоверных данных, полученных в результате проведения исследований по идентификации микроорганизмов и определения антибиотикочувствительности, на общую картину микробиологического мониторинга. Экспертная система выполняет следующие основные функции:
— Вносит коррективы в значения степени чувствительности, полученные при исследованиях In Vitro в готовый бланк анализа с целью выбора рациональной антибактериальной терапии и повышения ее эффективности;
— Система по результатам полученной In Vitro антибиотикограммы при выявлении не характерных для исследованной культуры данных чувствительности подсказывает врачу необходимость уточнения результатов идентификации данного микроорганизма.
- Поиск результатов анализов в базе данных выполняется по следующим параметрам:
— по номеру анализа;
— по дате поступления анализа (периоду поступления);
— по Ф.И.О. больного;
— по названию отделений;
— по названию диагнозов;
— по названию биоматериалов;
— по названию микроорганизмов;
— по названию антибиотиков.
Обеспечена возможность проведения поиска как по одному, так и по нескольким или всем перечисленным выше параметрам.
- Составление статистического отчета включает в себя расчет следующих показателей:
— количество выполненных анализов и обследованных больных;
— количество исследованных биоматериалов;
— количество положительных высевов;
— перечень и количество выделенных микроорганизмов, групп или подгрупп;
— количество монокультур;
— количество ассоциаций.
Обеспечена возможность получения статистического отчета за любой промежуток времени, по всем или любым отделениям, биоматериалам, диагнозам, выделенным микроорганизмам и антибиотикам. Все расчеты показателей статистического отчета содержат динамику изменения данных показателей по месяцам.
- Составление эпидемиологического отчета предназначено для проведения постоянного мониторирования микрофлоры, вызывающей воспалительные и гнойно-септические заболевания и осложнения, и слежения за уровнем антибиотикорезистентности выделенных микроорганизмов к антибактериальным препаратам, а также для выявления штаммов подозрительных на госпитальные с использованием для их поиска признака полирезистентности к антибактериальным препаратам.
Эпидемиологический отчет включает возможность расчета следующих показателей:
— спектр микроорганизмов с учетом исключения одинаковых микроорганизмов, выделенных от одного больного при многократных обследованиях;
— чувствительность микроорганизмов к антибактериальным препаратам с учетом исключения одинаковых по чувствительности одних и тех же микроорганизмов у одного больного при многократных обследованиях;
— активность антибактериальных препаратов в отношении выделенных микроорганизмов или их групп, подгрупп;
— количество и состав выделенных ассоциаций;
— результаты поиска госпитальных штаммов по признаку «полирезистентности» не менее чем к четырем антибактериальным препаратам при полной идентичности показателей степени чувствительности к другим изученным препаратам в антибиотикограмме.
Исключение повторных высевов одинаковых культур с одинаковой степенью чувствительности позволяет получить истинные данные о ведущей микрофлоре и уровне ее антибиотикорезистентности. Расчеты выполняются за любой промежуток времени, по всем или любым отделениям, биоматериалам, диагнозам, выделенным микроорганизмам и антибиотикам. Все эти показатели представлены в динамике по месяцам.
Программа «Микроб-Автомат» предназначена для автоматизации микробиологических исследований при использовании планшетных фотометров, оборудованных термостатом и встряхивателем, в клинико-диагностических лабораториях поликлиник, больниц, других ЛПУ и лабораториях санитарно-эпидемиологической службы. Программа «Микроб-Автомат» позволяет идентифицировать более 500 видов микроорганизмов и патогенных грибов.
Основные характеристики:
- Управление процессом измерения.
- Анализ и обработка результатов измерений при калибровке суспензий.
- Анализ и обработка результатов измерений биохимических тестов для идентификации микроорганизмов различных групп при использовании коммерческих наборов MIKRO-LA-TEST® и SENSI-LA-TEST® компании Erba Mannheim, сертифицированных к планшетным фотометрам iEMS-Reader, Multiskan Ascent и Multiskan FC (Thermo Fisher Scientific, Inc).
- Анализ и обработка результатов измерения приращения оптических плотностей при использовании коммерческих ТПК-тестов (определение степени чувствительности) и МПК-тестов (минимальноподавляющие концентрации) – для определения антибиотикочувствительности.
- Анализ и обработка результатов измерений кинетики размножения микроорганизмов в питательной среде и различных биоматериалах при динамическом измерении оптической плотности в ячейках планшета через равные промежутки времени при определенных длинах волн фотометрирования для решения следующих практических и научно-практических задач:
— определение степени обсемененности различных биоматериалов для подтверждения клинической значимости выделенных микроорганизмов в возникновении гнойно-воспалительного заболевания или осложнения;
— контроль эффективности проводимой антибактериальной терапии.
— оценка бактерицидности сыворотки крови больного для выявления интенсивности подавления противоинфекционных механизмов защиты, что позволяет выделить больных в группы риска по возникновению гнойно-воспалительных осложнений и предпринять соответствующие меры по их профилактике.
— построение кинетических моделей роста микроорганизмов.
- Вывод полученных результатов в файл, на экран и принтер в текстовом или графическом виде.
- Экспорт результатов идентификации и антибиотикочувствительности в базу данных программы «Система микробиологического мониторинга «Микроб-2»».
- Хранение (архивирование) результатов измерений в виде данных в формате планшета с целью повторных просмотров и анализа результатов.
- Хранение результатов идентификации и определения антибиотикочувствительности In Vitro согласно номерам анализов с целью возможной коррекции результатов идентификации после выполнения дополнительных тестов и сравнения чувствительности микроорганизмов до и после экспертной системы, работающей в программе «Система микробиологического мониторинга «Микроб-2»».